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二、明清时期的汉字注音伊始
反切刚刚产生的时候是容易学习和掌握的，当时一般人不仅可以通过反切认字，制造反切来注音，而且还能用反切来打哑谜、说隐语。后来反切变得难懂了，甚至有些读书人也往往不懂——这是因为语音不断发展变化，用当代音去读古人造的反切，自然不免隔膜。从中古到现代，汉语的声母和韵母都发生了很大变化，这正是近现代人使用中古反切感到不方便的根本原因。
1. 利玛窦的拼音
1605年，意大利传教士Matteo Ricci（利玛窦，1552—1610）最早采用了拉丁字母为汉字注音.
Matteo Ricci(直译为马泰奥-里奇，利玛窦是他的汉名，在中国颇受士大夫敬重，尊称为“泰西儒士”)。1582年(明万历十年)，利玛窦应召前往中国传教（先在澳门学习汉语），他是天主教在中国传教的开拓者之一，也是第一位阅读中国文学并对中国典籍进行钻研的西方学者。1583年，利玛窦获准与先期抵达的同胞Michele Ruggleri（罗明坚，1543-1607，法学博士，最早将西方油画引入中国，并将朱熹注的《四书》引入欧洲，与利玛窦并称“西方汉学之父”）入居广东，他们对明朝官员自称来自“天竺”，致使明朝人以为他们是佛教徒。利玛窦解释来中国的原因：“我们是从遥远的西方而来的教士，因为仰慕中国，希望可以留下，至死在这里侍奉天主”（他不敢直接回答传教的目的，否则他可能会被驱逐）。
为了传教，他们从西方带来了许多用品，比如地图、星盘和三棱镜等，还有欧几里得的《几何原本》（后与徐光启合译成中文，“点、线、面、平面、曲线、曲面、直角、钝角、锐角、垂线、平行线、对角线、三角形、四边形、多边形、圆心、外切、几何、星期”等词汇就是由他们创造并沿用至今的）。利玛窦带来的各种西方的新事物，吸引了众多好奇的中国人，特别是他带来的地图，令中国人眼界大开。传教之余，他广交官员和社会名流，传播西方天文、数学、地理等科学知识，他的著述不仅对中西交流作出了重要贡献，对日本和朝鲜半岛认识西方文明也产生了重要影响.
利玛窦制作了《坤舆万国全图》(1-3部分,1602年制于北京)这是中国历史上的第一张世界地图，北极、南极、地中海、日本海等词汇均出自此地图,该地图在中国先后被12次刻印，并很快在江户时代前期引入日本，使日本人传统的崇拜中华的“慕夏”观念发生根本改观
1605年，利玛窦撰写出《西字奇迹》（今改名《明末罗马字注音文章》，原书已失传），是中国汉字的第一个拉丁字母拼音方案（共26个声母，44个韵母），对日后汉语拼音的诞生具有开创性的系统化意义。
2. 金尼阁拼音
利玛窦去世后不久，法国耶稣会（天主教主要修会之一）传教士Nicolas Trigault（金尼阁，1577-1629，自称比利时人）神父于明万历卅八年（1610年）经澳门抵达北京，并着手整理利玛窦的札记。
1612年金尼阁回罗马汇报教务，掀起“中国热”。1620年与22位（因瘟疫、海上风暴及海盗侵袭，到达澳门仅幸存5人,其弟未能幸免）耶稣会士偕同教宗赠书7000余部再返中国，其中有Jean Terrenz（邓玉函，1576-1630，瑞士人，数学家和文学家，与伽利略同为欧洲科学院院士）和Johann Adam Schall von Bell（汤若望，德国人，1592-1666，继邓玉函之后管理明代历局，相当今天文台台长；曾任康熙老师；顺治常邀其入宫咨询）。
1626年，金尼阁出版了《西儒耳目资》，是最早用音素给汉字注音的字汇，所用的拼音方案是利玛窦方案的修正。西文名“汉字西语拼音词典”，最早的汉字拉丁字母注音书籍之一。中国大陆的汉语拼音编辑曾参考此书。
金尼阁是将《五经》介绍到欧洲的第一人，也是第一个系统编写中国编年史的西方人，他还将利玛窦的意大利文回忆录手稿翻译成拉丁文，以《利玛窦中国札记》为名刊发。随着1628年他在杭州病逝，“西书七千部”介绍给中国知识界的计划流产。后来，李之藻和王徵等人零星翻译了其中一些著作，大部分书籍蒙上尘埃，默默地流失。1938年，北平天主教堂整理藏书楼时发现了“七千部”中残余的数百部，其中有哥白尼的《天体运行论》和开普勒的《哥白尼天文学概要》等重要的科学典籍。
